本系成立於 2000.02.01，由前中興大學法商學院共同科國文組改制而來。

歷任系主任為馬寶蓮老師（任期 2000. 02. 01 ~ 2001. 07. 31）、吳順令老師（任期 2001. 08. 01 ~ 2004. 07. 31）、范銘如老師（任期 2004. 09. 01 ~ 2005. 07. 31）、賴賢宗老師（任期 2005. 08. 01 ~ 2009. 07. 31）、吳順令老師（代理任期 2009. 08. 01 ~ 2009. 09. 15）、賴賢宗老師（任期 2009. 09. 16 ~ 2012. 07. 31）、馬寶蓮老師（任期 2013. 08. 01 ~ 2016. 07. 31）、朱孟庭老師（任期 2016. 08. 01 ~ 2019. 07. 31）、陳大為老師（任期 2019. 08. 01 ~ 2021. 07. 31）、袁光儀老師（任期 2021. 08. 01 ~ 2023. 07. 31）、楊果霖老師（任期 2023. 08. 01 ~）

本系之組織架構共分為系務會議、系教評會、學術委員會、課程委員會、學生事務委員會、經費稽核委員會、系學會。2015. 08 起，本校古典文獻與民俗藝術研究所古典文獻組 3 位專任師資併入本系，本系目前有專任教師 16 人、兼任教師 16 人、助教 1 人、行政專員 1 人，學士班學生共 4 班約 180 餘人，碩士生 40 人左右。

本系經教育部核定，於 2009.08.01 起由「中國語文學系」改名為「中國文學系」（簡稱「中文系」）。本系自 2000 年成立之初，以傳統中文系的學識規模為本體，並發展「中國文哲當代詮釋」與「中文資訊化」的致用之學，以「中國文學系」為系名，符合本系現況與發展重點，亦符合本系學生求學深造與專長發展的需要。2020.07.01 ，本系以「經典詮釋」、「文學寫作」、「數位人文」作為新一階段的發展方向。

本系教育目標：1. 開拓亞太人文視野，落實全人教育。2. 培育中國文學研究與教學、數位應用、文學寫作、文化工作人才。

培養學生核心能力：

學士班：中文專業學術能力、經典詮釋能力、數位應用能力、寫作與表達能力、跨領域與跨國界視野。

碩士班：中文專業學術研究能力、經典詮釋及研究能力、數位應用及研究能力、寫作與表達能力、跨領域與跨國界視野及研究能力。